台灣曾是瘴癘之地，死於瘧疾者甚多。治瘧疾西洋醫生最常用的藥方就是奎寧（Quinine，又譯作金雞納霜）。府城醫館不僅在館內使用奎寧也曾通過各地教會普及其使用。
1886年醫館公佈寄售奎寧粉包的辦法。曰：現時西國的奎寧粉（文作ki-na-hun），大有路用，怕內山無法買得，而兄弟患寒熱（指瘧疾），要用而無法得，阮要寄也無法度寄。現在想出一種方法，就是把一罐的奎寧粉，改為散包，每包分量相同，用大漆封好，寄去各地傳道人，請他們代售，得款后再來辦購，方法如下：（1）每包售68錢3占（chiam），（2）購買以也為準，不得只購半包。（3）每包約1分重，大人1次服用，小孩可分3、4次服用，寒熱嚴重者，大人1次得服用2包。（4）每次要用現款購買。（5）這不是要做生意，是體貼人的需要，所以需用就來買，如無需用請勿購買去賺錢。（6）每罐裝26包，值1過重銀，賣完就把銀和罐寄回再添購（「台灣府城教公報」第12張，光緒12年6月刊，p.31-32）1890年報導：這幾年來寄到各地廉售的奎寧粉，已有幾百罐，但近來好幾個教會郤未再收到奎寧粉，並不是醫館不願寄。就是過去有些人經手領去奎寧郤未繳款，接辦的人不敢承擔，怕要對帳，而需負責還前缺，所以以后要付現款頒藥，不然日后生病，也就沒有藥了，（「台灣府城教公報」第59長，光緒16年3月刊p.25）
1893年改製奎寧丸供傳道人及其他獲准者（preachers
or any other approved persons）每罐裝120粒，值1重銀（a
heavy dollar），零售每粒1占9（Handbook,
382：6）。消息也見於教會報，安醫生叮嚀說：這不是要協助傳道人售藥品，是體貼教會兄弟姊妹或其他人而做的，也不是為了賺錢，盼傳道人長老執事了解原意，而願承擔（《台南府城教會報》第97張，光緒19年4月，p.40）。
改製奎寧丸寄售實施不久，就是1893年10月20日，教士會遂決議，不准傳道人員經售一切藥品，奎寧粉的經售也包括在內（Handbook,
480：2）。怎麼會受禁止呢？售奎寧不是助人的好事嗎？我曾提到傳道人經售了仁和堂鴉片丸受指責比吸食鴉片有害（參見《教會史話》 366及367）。教士會屢次禁鴉片丸之流傳而未見效，衡量之后遂決定傳道人員該專責，不涉於買賣買行為為宜。
