女學的開設需要有領導者。188年12月16日文安（Miss
Annie E. Buther）及朱約安（Miss Joan Stuart）兩姑娘抵台。她們受英國長老教會女宣道會派遣而來，其主要任務之一就是要辦女學。不過首先她們要學習語言（羅馬字、台語、漢文），了解本地風俗，參與探訪，協助婦幼等而忙碌。
1886年12月開設女學的公告出來。略云：茲訂於明年正月（舊曆）開設女學。通知共有7項。（1）凡要來就讀的女子，至少8歲，（2）女學備有床鋪、蚊帳、被枕及各種設備，供學生住宿使用；學生只要帶來自己要用的衣服就好，（3）每人每半年須繳付伙食費2圓（koe-tang
gin），（4）學科有白話字、寫字、算數、女紅〈
如做衣服、縫製襪）；但最要緊的是讀聖經，盼望學生從小就得聖靈感化，（5）校方會雇人來煮飯及做較粗重工作，但學生要樂意動手做其他較輕的工作，（6）在校裡須用的書冊、簿紙、筆墨等，校方都有準備，（7）要來就讀的女子就是不得纏足，凡己纏足者，必須先將它解開（見《台灣府城教會報》第17張，光緒12年11月刊，p.12）。請特別注意，不許纏足是入學要件（參見《教會史話》 331
） ，而學力卻不拘；又其收費僅男中學生之半。
女學於0887年2月14日（光緒13年正月22日）開學。典禮於下午3時開始，有牧師、醫生、先生、先生娘、姑娘及學生參加（《台灣府城教會報》第20張、光緒13年12月刊，p.10）。是日典禮由文安姑娘主理、朱約安奏樂，所讀經句是約翰福音第3章第16節，巴克禮牧師證道。巴牧師很高興地說：「感謝上帝大慈悲，今日慶祝台南新樓女學出世……。」並祝福說：「祈求天父與這學校同在，來榮耀祂。」
開學時學生有19名。因為住宿設備不夠，就准許居府城內者通學，而住校者有13名。學生分為4個班級。文安、朱約安兩位姑娘共同主持校務並任教，另有府城內六（lak）兄（陳六）的女兒也教書（參見《教會史話》 332
） ，而（黃）深河嬸於校內協助教導唱歌兼照顧學生（舍監）。
高侯青蓮曾談開學當初，說：學生必嚴守10條校規，輪流參與炊事、兩人一組整理內務；每年繳付4圓，包括每日3餐，每餐4菜1湯；學生自己做衣服、鞋子，清掃環境，而不得隨便買零食吃。她加一句說：在這種環境訓練之下，學生個個健康可愛，怪不得有句俗語說「吃到長女水，不肥也要美（讀sui）」，（八十週年校慶紀念特刊，p.22
）。
